Y gwahaniaeth mawr rhwng silindr hydrolig a silindr niwmatig yw'r ffordd y mae'r silindr yn gweithio mewn gwirionedd. Mae silindrau niwmatig yn defnyddio nwy, aer neu nwy pur fel arfer, i drosglwyddo pŵer drwy nwy cywasgedig. Ar y llaw arall, mae system hydrolig y silindr hydrolig yn defnyddio hylifau, olew fel arfer, glycol ethylen ac opsiynau hylif gwrthardretydd fflam eraill.
Yn gyffredinol, mae silindrau niwmatig yn aer neu nwy cywasgedig, a fydd yn cynhyrchu grym llinellol. Maent yn systemau dan bwysau sy'n cywasgu aer neu nwy i gynhyrchu grymoedd sy'n caniatáu symud. Anfantais systemau niwmatig silindrau niwmatig yw na allant gynhyrchu mwy na 100 o bunnoedd fesul modfedd sgwâr mewn gwirionedd. Gan fod silindrau niwmatig yn gweithio gydag aer cywasgedig, mae'r mudiad yn cael ei ohirio, ac mae angen ffynhonnell "cywasgydd" gyson i gadw pethau i fynd.
Ar y llaw arall, mae'r silindr hydrolig yn cynnwys system wasgu yn hytrach na phwyso nwy neu hylif. Mae'r silindr hydrolig dan bwysau yn defnyddio'r hylif sy'n llifo i symud y pwysau i wahanol ardaloedd, gan gynhyrchu'r grym ar gyfer symud yr ardaloedd hyn yn ôl yr angen. Gall silindrau hydrolig gynhyrchu mwy o rym, fel arfer yn amrywio o 1500 i 10000 psi, sy'n amlwg yn llawer mwy na silindrau niwmatig.
